Note du 29 juin 2020
Sans connaitre encore le temps que dureront les mesures de distances sociales liées à la pandémie de Covid-19, et quels que soient les changements qui ont dû être opérés dans l’évaluation de la session de juin 2020 par rapport à ce que prévoit la présente fiche descriptive, de nouvelles modalités d’évaluation des unités d’enseignement peuvent encore être adoptées par l’enseignant ; des précisions sur ces modalités ont été -ou seront-communiquées par les enseignant·es aux étudiant·es dans les plus brefs délais.
Sans connaitre encore le temps que dureront les mesures de distances sociales liées à la pandémie de Covid-19, et quels que soient les changements qui ont dû être opérés dans l’évaluation de la session de juin 2020 par rapport à ce que prévoit la présente fiche descriptive, de nouvelles modalités d’évaluation des unités d’enseignement peuvent encore être adoptées par l’enseignant ; des précisions sur ces modalités ont été -ou seront-communiquées par les enseignant·es aux étudiant·es dans les plus brefs délais.
3 crédits
15.0 h + 20.0 h
Q2
Enseignants
Gatto Laurent;
Langue
d'enseignement
d'enseignement
Français
Préalables
Le(s) prérequis de cette Unité d’enseignement (UE) sont précisés à la fin de cette fiche, en regard des programmes/formations qui proposent cette UE.
Thèmes abordés
Ce cours introductif à la bioinformatique et sciences des données appliquées aux sciences biomédicales introduira les méthodologies et technologies utilisées en bioinformatique. Les étudiants apprendront comment gérer un projet bioinformatique et comment manipuler et visualiser des jeux de données de tailles moyennes.
Acquis
d'apprentissage
d'apprentissage
A la fin de cette unité d’enseignement, l’étudiant est capable de : | |
| 1 | A l'issue de ce cours, les étudiants auront une compréhension que ce qu'est la bioinformatique et quand la bioinformatique leur sera requise. Ils seront également en mesure de
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La contribution de cette UE au développement et à la maîtrise des compétences et acquis du (des) programme(s) est accessible à la fin de cette fiche, dans la partie « Programmes/formations proposant cette unité d’enseignement (UE) ».
Contenu
Ce cours introductif à la bioinformatique abordera les thèmes suivants :
-
Qu'est-ce que la bioinformatique et quelles sont ses domaines d'applications.
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Technologies and méthodologies utilisées en bioinformatique
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Introduction aux technologies et données omiques.
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Gestion de projet d'analyse de données et recherche reproductible.
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Organisation de données dans des tableurs.
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Utilisation de l'environnement de programmation RStudio.
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Notions pratiques d'analyse de données et de programmation sous en R.
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Introduction aux structures de données élémentaires sous R.
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Manipulation et visualisation de données.
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Analyses et structures de données haut-débit avec R et Bioconductor.
Méthodes d'enseignement
Le cours sera dispensé sous forme de travaux pratiques, au cours desquels les étudiants seront amenés à réaliser des exercices de programmation suivant des problèmes concrets rencontrés en sciences biomédicales, en utilisant le langage de programmation R et l'environnement de programmation RStudio.
La présence des étudiants à l'ensemble des cours (volumes 1 et 2) est obligatoire. Les présences seront comptabilisées. En case de trois absences non justifiées, l'étudiant(e) pourra se voir refuser la participation aux examens de fin de cours.
La présence des étudiants à l'ensemble des cours (volumes 1 et 2) est obligatoire. Les présences seront comptabilisées. En case de trois absences non justifiées, l'étudiant(e) pourra se voir refuser la participation aux examens de fin de cours.
Modes d'évaluation
des acquis des étudiants
des acquis des étudiants
L'évaluation se fera sur ordinateur ; les étudiants prépareront un rapport reproductible en Rmd sous RStudio, répondant à des exercices et préparant des analyses de petites tailles tels que présentés et pratiqués durant le cours.
Ressources
en ligne
en ligne
Le cours est accessible en ligne: https://uclouvain-cbio.github.io/WSBIM1207/
Faculté ou entité
en charge
en charge
SBIM
