Bioinformatique

wsbim1322  2019-2020  Bruxelles Woluwe

Bioinformatique
Note du 29 juin 2020
Sans connaitre encore le temps que dureront les mesures de distances sociales liées à la pandémie de Covid-19, et quels que soient les changements qui ont dû être opérés dans l’évaluation de la session de juin 2020 par rapport à ce que prévoit la présente fiche descriptive, de nouvelles modalités d’évaluation des unités d’enseignement peuvent encore être adoptées par l’enseignant ; des précisions sur ces modalités ont été -ou seront-communiquées par les enseignant·es aux étudiant·es dans les plus brefs délais.
3 crédits
30.0 h + 10.0 h
Q1
Enseignants
Gatto Laurent;
Langue
d'enseignement
Français
Préalables

Le(s) prérequis de cette Unité d’enseignement (UE) sont précisés à la fin de cette fiche, en regard des programmes/formations qui proposent cette UE.
Thèmes abordés


Ce cours de bioinformatique approfondira les compétences acquises dans le cours d'introduction à la bioinformatique WSBIM1207. En particulier, des notions plus avancées de programmation et d'analyse et de visualisation de données seront présentées ainsi des outils d'apprentissage automatique et statistiques. Des bases de design expérimental seront également introduites. Les notions de donnés omiques et de leurs analyses seront également approfondies.  
Acquis
d'apprentissage

A la fin de cette unité d’enseignement, l’étudiant est capable de :

1 A l'issue de ce cours, les étudiants  
  • Auront acquis les fondements de designs expérimentaux.  
  • Auront approfondis leurs compétences en programmations sous R.  
  • Auront approfondis leurs compétences en analyses de données.  
  • Se seront familiarisés avec des techniques de transformation et visualisation de donnée plus avancées.  
 

La contribution de cette UE au développement et à la maîtrise des compétences et acquis du (des) programme(s) est accessible à la fin de cette fiche, dans la partie « Programmes/formations proposant cette unité d’enseignement (UE) ».
Contenu
Ce cours de bioinformatique abordera les thèmes suivants :  
  • Approfondissement de notions de programmation en R.  
  • Designs expérimentaux utilisé en analyses omiques.  
  • Transformation et visualisation de données omiques.  
  • Analyse et exploration de données multivariées.  
Méthodes d'enseignement
Le cours sera dispensé sous forme de travaux pratiques, au cours desquels les étudiants seront amenés à réaliser des exercices de programmation, en utilisant le langage de programmation R et l'environnement de programmation RStudio.  
La présence des étudiants à l'ensemble des cours (volumes 1 et 2) est obligatoire. Les présences seront comptabilisées. En case de trois absences non justifiées, l'étudiant(e) pourra se voir refuser la participation aux examens de fin de cours.  
Modes d'évaluation
des acquis des étudiants
L'évaluation se fera sur ordinateur ; les étudiants prépareront un rapport reproductible en Rmd sous RStudio, répondant à des exercices et préparant des analyses de petites tailles tels que présentés et pratiqués durant le cours. 
Ressources
en ligne
Le cours est accessible en ligne: https://uclouvain-cbio.github.io/WSBIM1322/
Faculté ou entité
en charge
SBIM


Programmes / formations proposant cette unité d'enseignement (UE)

Intitulé du programme
Sigle
Crédits
Prérequis
Acquis
d'apprentissage
Approfondissement en sciences biomédicales

Bachelier en sciences biomédicales