ImageJ

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ImageJ

ImageJ est un logiciel gratuit, développé par le NIH, basé sur le langage JAVA, largement utilisé par la communauté scientifique. De nombreux "plug-in" et macros sont disponibles et permettent d'effectuer des opérations sur mesure.

 

Exemples d'applications

  • Comptage nucléaire

Cellules endothéliales - IF cavéoline/Connexine/DAPI

image .zvi acquise en illumination structurée (AxioImager.z1/ApoTome) - objectif 40x


  • Analyse d'intensité de marquage fluorescent

Cardiomyocytes - IF OGT/alpha-sr-actinin/DAPI

image .zvi acquise en illumination structurée (AxioImager.z1/ApoTome) - objectif 63x

Quantification de la surface rouge au-delà d'un seuil (cellulaire, nucléaire, cytoplasmique)

Pour en savoir plus...


  • Analyse de la distance entre lysosomes et noyau

 

Cellules tumorales- IF LAMP1/WGA/DAPI

image .zvi acquise en illumination structurée (AxioImager.z1/ApoTome) - objectif 40x

Pour en savoir plus...

 


  • Assemblage d'une mosaïque à partir d'images individuelles se chevauchant (plugin MosaicJ)

 

Reconstitution d'une coupe de coeur de souris (marquage WGA-rhodamine) à partir d'images acquises en épifluorescence (AxioImager.z1)


Plugins et macros utiles:

LOCI Tools (ouverture de divers formats d'image)

Cell counter (comptage manuel de plusieurs types cellulaires)

Angiogenesis analyzer (analyse de réseaux cellulaires)

FAQ