Le master en médecine comporte trois blocs annuels de 60 crédits chacun.
Les deux premiers constituent le socle de la formation théorique commune à tous les futurs médecins. Ils sont constitués d'enseignement magistraux, de cliniques et de stages. Ces derniers se déroulent chaque fois au second quadrimestre, et ont une durée de 12 semaines pour chaque bloc. Durant les stages, les étudiants suivent chaque semaine, une journée de retour consacrée à la démarche clinique adulte et pédiatrique, ainsi qu’à des enseignements de formation à la relation et d’enjeux sociaux et éthiques de la santé et de la médecine. Ces enseignements peuvent faire l’objet de travaux pratiques et/ou de séminaires en petits groupes.
Le dernier bloc est consacré aux stages qui intègrent, à l’instar des blocs 1 et 2, des journées de retour. Il comprend également la défense du travail de fin d’études, l’examen de synthèse et la préparation des concours.
Sur l’ensemble des 3 blocs du master, les étudiants sont en stage durant 60 semaines.
L'étudiant prépare un travail personnel de fin d'études qu’il présente en dernier bloc annuel de master.