Fondée en 1925 comme institution annexe à l’Institut Saint-Louis – entre-temps devenu les Facultés universitaires Saint-Louis, puis l’Université Saint-Louis Bruxelles, et aujourd’hui l’UCLouvain Saint-Louis Bruxelles –, l’École des sciences philosophiques et religieuses a pour mission de croiser les domaines de la philosophie, de la théologie, des sciences religieuses et plus largement des sciences humaines. Elle propose dans cet esprit des activités d’enseignement, de recherche et de service à la société à tous les membres de la communauté universitaire et à tout public extérieur.
L’École n’a jamais cessé de faire évoluer ses programmes. Les formats de ses activités sont variés, allant de la chaire de philosophie ou de sciences religieuses de deux jours complets, aux journées d’étude, conférences, séminaires, etc. Elle organise également un certificat en sciences sociales et religieuses sur l’islam dans le monde contemporain. Une conférence de rentrée est organisée au début de chaque année académique.
De nombreuses personnalités philosophiques et scientifiques de grande renommée ont été invitées depuis 1965. Parmi elles, on peut citer : Michel Henry, Georges Canguilhem, Jean Starobinski, Jean Hyppolite, Michel Deguy, Emmanuel Levinas, Jacques Derrida, André Leroi-Gourhan, Jean Baufret, Paul Ricoeur, Eric Weil, Michel Serres, Gérard Genette, Jean Ladrière, Tzevan Todorov, Louis Althusser, René Girard, Jean-Pierre Vernant, Henri Maldiney, Ilya Prigogine, Cornelius Castoriadis, Claude Lefort, Yves Bonnefoy, Jean-Luc Marion, Jean Laplanche, Michel de Certeau, Nicole Loraux, Julia Kristeva, Claude Hagège, Barbara Cassin, Jacques Le Goff, Yves Coppens, Pierre Bourdieu, Jean-Marc Ferry, Antoine Garapon, Chantal Mouffe, Jocelyn Benoist, Georges Didi-Huberman, Marie-José Mondzain, Quentin Meillassoux, Giorgio Agamben, Jean-Luc Nancy, Vincent Descombes, Philippe Descola, Patrick Boucheron, Markus Gabriel, Etienne Balibar, Martin Rueff, Carlo Ginzburg.
En 2019, suite à la fin de la présidence du Professeur Laurent Van Eynde, la décision a été prise de revoir l’organisation de l’École en prévoyant l’élection de deux co-présidents, l’un plus spécialement en charge des activités dans le domaine philosophique et l’autre plus spécialement en charge des activités dans le domaine des sciences religieuses. Chacun de ces deux présidents est habilité à constituer une commission composée de personnes expertes dans le domaine considéré, le Comité de direction de l'École conservant la compétence de déterminer la politique et la stratégie de celle-ci. Les Professeurs Hugues Dumont et Isabelle Ost ont présidé ensemble l’École de 2019 à 2024. En 2024, Isabelle Ost cède la place à la Professeur Valérie Aucouturier.